木瓜是有籽的，籽就在果肉中，切开木瓜果实就能看到籽，数量非常多。一般来说，未成熟的木瓜籽未是白色的，而成熟的木瓜籽是黑褐色的，球体，比较硬。木瓜籽能吃，但最好不要直接吃，因为它的味道非常苦涩，但是可以磨碎后服用。
木瓜种子可以种植，方法也非常简单，一般在春天进行，栽培时从木瓜中挖出种子，洗净后浸泡催芽，每天换水，4~5天就可以取出播种，准备好容器和土壤，然后将种子放进土壤里，浇水等待发芽。
