危害芦荟的疾病有锈病、褐斑病、叶枯病等。其中锈病需要将患病处剪除销毁，以防其传染，褐斑病可用百菌清溶液喷洒治疗，叶枯病则要用波尔多液治疗。针对它的各种害虫，多以防治为主，可以用甲基托布津和多菌灵消灭虫源，患病后可以用敌百虫进行喷杀。
